Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 KIR3DP1-201ENST00000580853 628 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 MCRIP2P2-201ENST00000605276 209 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009053.4-201ENST00000614366 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ICAM1-201ENST00000264832 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 AL353795.3-201ENST00000624351 5702 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 BUB1B-201ENST00000287598 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF235-201ENST00000291182 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 MFSD6-201ENST00000281416 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAMTS12-201ENST00000352040 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 LIG4-202ENST00000405925 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 MADD-205ENST00000395344 4988 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 SCARA3-201ENST00000301904 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01498-201ENST00000502160 2984 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 C5orf56-201ENST00000337752 4767 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF469-201ENST00000437464 13203 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 DAAM1-201ENST00000360909 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 STAG3-219ENST00000620100 4203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 STX16-206ENST00000371132 4552 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 BTBD7-202ENST00000334746 8430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP8B1-201ENST00000283684 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 POGZ-201ENST00000271715 6626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CSMD2-205ENST00000373381 13698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 SMG7-215ENST00000515829 5629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CARF-201ENST00000320443 5209 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFHX2-202ENST00000419474 9182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 SLITRK3-202ENST00000475390 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 SCAF11-205ENST00000465950 5296 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC16A-204ENST00000313084 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 AL137127.1-201ENST00000606379 3402 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 SPHKAP-202ENST00000392056 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 SP1-202ENST00000426431 7603 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 LIPH-201ENST00000296252 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 NBPF15-203ENST00000577412 4707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 DENND2C-201ENST00000393274 6163 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CRNKL1-202ENST00000377340 4406 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR156-203ENST00000464295 4442 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ADD2-201ENST00000264436 9267 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 DRP2-202ENST00000395209 7277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 EPHB2-204ENST00000400191 10816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 TMCC1-201ENST00000393238 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ITIH3-211ENST00000621946 3038 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 SEMA6A-210ENST00000510263 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 THSD7B-201ENST00000272643 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 EPB41-206ENST00000373798 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CYB5B-202ENST00000512062 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF9-202ENST00000374870 4644 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF613-201ENST00000293471 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 USP6-205ENST00000574788 8464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 CLU-201ENST00000316403 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC6A12-203ENST00000424061 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 EPB41L2-216ENST00000527411 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RTL1-201ENST00000534062 4193 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 NTRK3-221ENST00000629765 2714 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP442-201ENST00000365050 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP2B2-203ENST00000383800 8900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR128-2-201ENST00000384893 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLV5-45-201ENST00000390296 397 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD3J-201ENST00000408473 190 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 AL035417.1-201ENST00000442754 214 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 AL929410.2-201ENST00000451170 189 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL318P-201ENST00000471955 297 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 ENPP7P3-201ENST00000509123 241 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 AC106774.1-201ENST00000515105 321 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 TDGF1P5-201ENST00000523009 453 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 AC144548.1-201ENST00000549577 324 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 TUBAP4-201ENST00000569261 416 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL474P-201ENST00000583485 301 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.5 ms