Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPN7Q9Y6W3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPN7Q9Y6W3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPN7Q9Y6W3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPN7Q9Y6W3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPN7Q9Y6W3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPN7Q9Y6W3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPN7Q9Y6W3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPN7Q9Y6W3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPN7Q9Y6W3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPN7Q9Y6W3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPN7Q9Y6W3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPN7Q9Y6W3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPN7Q9Y6W3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPN7Q9Y6W3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms