Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAB39Q9Y376 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms