Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNRF3Q9ULT6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms