Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
AMFRQ9UKV5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMFRQ9UKV5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms