Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ94

LINC00527, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00527, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00527Q9UJ94 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00527Q9UJ94 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00527Q9UJ94 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms