Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL9Q9P2J3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms