Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TVP23BQ9NYZ1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23BQ9NYZ1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms