Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC39A9Q9NUM3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms