Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB18Q9NP72 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB18Q9NP72 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms