Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLSTN2Q9H4D0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms