Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms