Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA4CQ9C0C4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms