Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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FOXQ1Q9C009 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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FOXQ1Q9C009 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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FOXQ1Q9C009 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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FOXQ1Q9C009 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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FOXQ1Q9C009 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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FOXQ1Q9C009 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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FOXQ1Q9C009 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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FOXQ1Q9C009 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXQ1Q9C009 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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