Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM3Q9BZL3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms