Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM54Q9BYV2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM54Q9BYV2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms