Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNG6Q9BXT2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNG6Q9BXT2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms