Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms