Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC39A3Q9BRY0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms