Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMSS1Q9BQ75 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms