Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RETNLBQ9BQ08 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms