Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5SQ99766 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5SQ99766 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms