Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms