Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 LMO3-212ENST00000535535 1488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms