Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP53Q96M91 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP53Q96M91 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP53Q96M91 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CFAP53Q96M91 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CFAP53Q96M91 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CFAP53Q96M91 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CFAP53Q96M91 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP53Q96M91 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms