Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms