Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCANQ96GW7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms