Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms