Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRF1Q92994 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms