Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GTF3AQ92664 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3AQ92664 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms