Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC4Q8WW27 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms