Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNPDA2Q8TDQ7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms