Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms