Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ7

PROCA1, Protein PROCA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROCA1Q8NCQ7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROCA1Q8NCQ7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PROCA1Q8NCQ7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PROCA1Q8NCQ7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PROCA1Q8NCQ7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PROCA1Q8NCQ7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PROCA1Q8NCQ7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PROCA1Q8NCQ7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROCA1Q8NCQ7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms