Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKAP1Q86WV1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKAP1Q86WV1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms