Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYDE1Q6ZW31 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYDE1Q6ZW31 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms