Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRIG3Q6UXM1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LRIG3Q6UXM1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LRIG3Q6UXM1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
LRIG3Q6UXM1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
LRIG3Q6UXM1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG3Q6UXM1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms