Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC25A47Q6Q0C1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms