Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAVIN1Q6NZI2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAVIN1Q6NZI2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms