Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFCAB12Q6NXP0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFCAB12Q6NXP0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms