Protein–RNA interactions for Protein: Q6BDS2

UHRF1BP1, UHRF1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1BP1Q6BDS2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
UHRF1BP1Q6BDS2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC28■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UHRF1BP1Q6BDS2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms