Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRNL1Q5VV63 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms