Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT6Q5T7P8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT6Q5T7P8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms