Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM41BQ5BJD5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM41BQ5BJD5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms