Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P5Q59GN2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms