Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TDRD12Q587J7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms