Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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