Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP2B3Q16720 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B3Q16720 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms