Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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GABRA6Q16445 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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GABRA6Q16445 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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GABRA6Q16445 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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GABRA6Q16445 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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GABRA6Q16445 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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GABRA6Q16445 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABRA6Q16445 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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