Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
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NCOA1Q15788 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
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